โรงเรียนบ้านยางเกี่ยวแฝก ตั้งขึ้นเมื่อพ.ศ.2513 โดยใช้ศาลาการเปรียญวัดยางเกี่ยวแฝก
เป็นที่เปิดทำการเรียนการสอนในครั้งแรก โดยเปิดทำการสอนในระดับชั้น ป.1 ถึง ป.4 โดยมี
นายแหลม วัชรมาลีกุล เป็นครูใหญ่คนแรกต่อมาเมื่อวันที่ 1 พฤษภาคม พ.ศ.2516ได้ย้ายมา
เรียนในที่แห่งใหม่ ซึ่งเป็นที่ดินที่จัดไว้สำหรับปลูกสร้างโรงเรียน ในเนื้อที่ 16 ไร่ 3 งานกับ
20 ตารางวา และในปี พ.ศ.2522 ได้ขยายการสอนถึงระดับชั้นประถมศึกษาปีที่ 6 และในปี
พ.ศ.2531 นายแหลม วัชรมาลีกุล ได้เกษียณอายุราชการทางราชการจึงแต่งตั้งให้นายปฐม
กล้าหาญ มาดำรงตำแหน่งครูใหญ่แทน และในปี พ.ศ.2536 ได้เปิดขยายชั้นเรียนเพิ่มขึ้น
ตั้งแต่ระดับปฐมวัย, ระดับชั้นประถมศึกษา และระดับชั้นมัธยมศึกษาตอนต้น ตามโครงการ
ขยายโอกาสทางการศึกษาในสมัยนัน
โรงเรียนบ้านยางเกี่ยวแฝก มีเขตบริการครอบคลุม 6 หมู่บ้านจึงได้แยกสาขาออกเป็น 2
สาขา คือโรงเรียนบ้านยางเกี่ยวแฝก สาขาซับสมบูรณ์ ซึ่งตั้งอยู่ที่บ้านซับสมบูรณ์ หมู่ที่ 9
ต.วะตะแบก อ.เทพสถิต จ.ชัยภูมิ และโรงเรียนบ้านยางเกี่ยวแฝกสาขาบ้านหนองกระโจมซึ่ง
ตั้งอยู่ที่บ้านหนองกระโจม หมู่ที่ 16 ต.วะตะแบก อ.เทพสถิต จ.ชัยภูมิ
ในปีการศึกษา 2535 ทางราชการได้อพยพประชากรบ้านซับสมบูรณ์ ออกจากพื้นที่ป่า
อนุรักษ์ตามโครงการ ค.จ.ก. มาอยู่ในที่แห่งใหม่ซึ่งใกล้กับโรงเรียนแม่ ภายหลังจึงได้ยุบรวม
โรงเรียนบ้านยางเกี่ยวแฝกสาขาซับสมบูรณ์เข้ากับโรงเรียนแม่ และในปีการศึกษา 2546 ก็ได้
ยุบรวมห้องเรียนโรงเรียนบ้านยางเกี่ยวแฝก สาขาบ้านหนองกระโจม ด้วยเช่นกัน เนื่องจากมี
ปัญหาขาดแคลนบุคลากรครู
ปีการศึกษา2560 โรงเรียนบ้านยางเกี่ยวแฝก สังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถม
ศึกษาชัยภูมิ เขต 3 สำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน กระทรวงศึกษาธิการ เปิด
สอนตั้งแต่ระดับชั้น อนุบาล - ชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 3 เป็นโรงเรียนขยายโอกาสทางการศึกษา
เป็นโรงเรียนดีใกล้บ้าน มีคณะครู จำนวน 28 คน นักเรียนทั้งสิ้น 460 คน เปิดสอนตาม
หลักสูตรปฐมวัย พ.ศ.2546 และหลักสูตรแกนกลางการศึกษาขั้นพื้นฐาน พุทธศักราช 2551